怎么从贫瘠的土壤中提取微生物宏DNA?
来源:学生作业帮 编辑:搜狗做题网作业帮 分类:生物作业 时间:2024/08/20 06:43:53
怎么从贫瘠的土壤中提取微生物宏DNA?
土壤pH值低,在3-6之间,有机物含量很低,微生物量少.
采用Mo Bio试剂盒提取DNA,琼脂糖凝胶电泳没有条带,PCR扩增时,有些样品能扩增出来.
提取的DNA量少,无法用于测序.
请问有什么好法子能从微生物量少的土壤中提取出较多的DNA呢?
土壤pH值低,在3-6之间,有机物含量很低,微生物量少.
采用Mo Bio试剂盒提取DNA,琼脂糖凝胶电泳没有条带,PCR扩增时,有些样品能扩增出来.
提取的DNA量少,无法用于测序.
请问有什么好法子能从微生物量少的土壤中提取出较多的DNA呢?
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.DNA 直接测序吗?宏基因组就算能测出来 估计也拼不出来吧.也是要扩增后测序.
难道因dna 浓度低 就扩增不到条带了?在pcr上下下功夫,实在不行就做巢式.
另外试剂盒往往一一般会追求比较高的纯度,这样损失也大些,试试SDs 裂解的手提的方法.效果可能会好的 只不过酸性土壤手提最后的 腐植酸浓度太大 PCR 难度增加.加BSA可缓解.
难道因dna 浓度低 就扩增不到条带了?在pcr上下下功夫,实在不行就做巢式.
另外试剂盒往往一一般会追求比较高的纯度,这样损失也大些,试试SDs 裂解的手提的方法.效果可能会好的 只不过酸性土壤手提最后的 腐植酸浓度太大 PCR 难度增加.加BSA可缓解.