perl 计算氨基酸对的频率

来源：学生作业帮编辑：搜狗做题网作业帮分类：综合作业时间：2024/08/05 11:30:23

perl 计算氨基酸对的频率
我的源文件seq如下：

现在要做如下处理,计算每一行间隔为k的氨基酸对出现的频率.比如,第一行,间隔为三（k=3）的氨基酸对是,NR,GT,LQ,IT,需要统计这么些个氨基酸对出现的频率并输出.总次数很好算,直接利用length($seq)-k-1.
可是,我没有办法统计氨基酸对出现的次数,还是举第一行的例子,就是我没很好的办法实现统计NR出现过几次,这样我就没法计算NR对出现的频率了

#!/usr/bin/perl
use strict;
use warnings;
open (IN, "amin.txt"); ##输入文件
open (OUT,">result.txt"); ##输出文件
my $k=3;
print OUT "Row_Number\tAmino-acid-pair\tcounts\n"; ##结果文件格式行氨基酸对本行出现次数
my %amin;
my $line=1;
while(){
chomp;
my $seq=$_;
for(my $i=0;$i

perl 计算氨基酸对的频率如何用perl读入一个文件,计算文件中各个单词的出现频率,再输出 perl $@ 氨基酸的计算有关氨基酸的计算, 有关氨基酸的计算关于氨基酸的计算如何用perl编写程序计算数学公式,比如计算键盘输入数字的log值 perl中统计单词出现频率的一段代码,大家帮我看看我那里错了? 已知AA基因型频率0.2Aa基因型频率0.6aa基因型频率0.2求A的基因频率为什么不能直接对AA基因型频率开方计算用perl怎么计算一个文本中的每一行包含另一文本的单词数. 基因频率的计算