perl分析基因序列就是给出一个.fa类型的文件,找出其中的N长度,GC长度,GC比例等信息.

来源：学生作业帮编辑：搜狗做题网作业帮分类：数学作业时间：2024/07/30 17:32:50

perl分析基因序列
就是给出一个.fa类型的文件,找出其中的N长度,GC长度,GC比例等信息.

#!/usr/bin/perl -w
use strict;
open my $fhin,$ARGV[0];
my ($seq,$g,$c);
while(my $line = ){
chomp($line);
$seq .= $line;
print $line;
$g += () = $line m/[Gg]/g;
$c += () = $line m/[Cc]/g;
}
my $length = length($seq);
print "Sequence length is:".$length."\nContains ".$g." Gs and ".$c." Cs\nGC percentage is:".(($g+$c)/$length).".\n";

perl分析基因序列就是给出一个.fa类型的文件,找出其中的N长度,GC长度,GC比例等信息. pcr 一段2000多bp的基因引物设计时条件怎么设包括引物长度 gc含量等因为我用软件设计时总是设不出来可以有两个fastaq格式的DNA序列文件,想写一个perl程序完成! 高GC基因的荧光定量能不能加DMSO 已知引物序列,如何知道目的基因的长度引物的长度包括酶切位点在内么?计算Tm值以及计算GC含量时用算酶切位点的么? 糗百里的GC是什么意思出口贸易里的GC是什么意思? GC项目的含义是什么? 长度为n的整数序列,把序列中的最小值与第一个数交换,最大值与最后一个数交换已知目的基因SCN2B,怎样确定基因序列和编码区的长度? 如何利用生物信息学分析一个基因的DNA序列