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我做OCT4与wnt通路的关系.不知道合成哪个SiRNA-OCT4.我查了一下,有三个相关基因编码.在NCBI上查的.

来源:学生作业帮 编辑:搜狗做题网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/07/31 01:05:29
我做OCT4与wnt通路的关系.不知道合成哪个SiRNA-OCT4.我查了一下,有三个相关基因编码.在NCBI上查的.
NM_001173531.1 NM_002701.4 NM_203289.4 请问有人知道吗?谢谢
我做OCT4与wnt通路的关系.不知道合成哪个SiRNA-OCT4.我查了一下,有三个相关基因编码.在NCBI上查的.
推荐NM_001173531.1 ,首先,第1个和第3个序列是一样的东西,其蛋白也完全相同,而第3个序列完全涵盖第1个序列,因此如果有效干扰NM_001173531.1,第3个序列NM_203289.4 也应当可以被干扰下去.然后比较第一第二个序列,这两个剪切变体差别很大,很难用一个的sirna就保证能够干扰另一个,但是从coding sequence上看,第1个序列NM_001173531.1又被NM_002701.4的cds涵盖,所以如果干扰序列能够直接干扰到NM_001173531.1的cds序列,应该也可以较为有效的干扰剪切变体1.第二点这种说法没有特别明确的科学依据,但是从本人实践来看,可能性还是比较大的.如果涉及不同组织,那么可以在ucsc上查看个变体在不同组织的丰度从而根据组织特异性进行选择