我要用western检测一种细胞系中分泌蛋白的表达,eg:细胞因子,是检测培养液中的蛋白还是细胞抽提物种的呢
来源:学生作业帮 编辑:搜狗做题网作业帮 分类:生物作业 时间:2024/08/07 02:56:39
我要用western检测一种细胞系中分泌蛋白的表达,eg:细胞因子,是检测培养液中的蛋白还是细胞抽提物种的呢
我个人觉得分泌蛋白是通过分泌到细胞外之后产生作用的,那就应该检测培养液中的蛋白了,但是又是从细胞中分泌出来的,检测细胞抽提物中的应该也说得通,那究竟应该以那个为准呢?或者两个都检测,研究某种物质对此蛋白的表达量的影响时,两个地方的蛋白含量变化检测结果会是一致的吗?
或者不用western,其它的方法?免疫组化?
我个人觉得分泌蛋白是通过分泌到细胞外之后产生作用的,那就应该检测培养液中的蛋白了,但是又是从细胞中分泌出来的,检测细胞抽提物中的应该也说得通,那究竟应该以那个为准呢?或者两个都检测,研究某种物质对此蛋白的表达量的影响时,两个地方的蛋白含量变化检测结果会是一致的吗?
或者不用western,其它的方法?免疫组化?
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你不妨对细胞内外的蛋白都做一个检测,但是检测细胞外的蛋白比较麻烦.因为培养基的成分本身很复杂.等细胞长满后用完全培养基培养24小时,然后用PBS洗两遍,加Hepes溶液,使细胞覆盖就行.培养2-3天收集培养液离心,浓缩上清至原体积的1/30-1/10,然后做western检测.如果还检测不出来就用上述液做个免疫沉淀,然后做western.但这样就误差太大,基本看不出来变化.所以建议:(1)以细胞内的蛋白做,刺激时间不要过长.(2)用表达量与此蛋白有直线相关的其他蛋白来代替,比如其信号通路上下游的一些激酶之类的.
再问: 觉得你说的最靠谱,你说浓缩上清至原体积的1/30-1/10,是浓缩离心还是氮吹?这个时间应该有点长,总觉得怕蛋白降解或者不稳定啊。 我看的文献都是取上清做的,但是没有说具体操作。 老师的建议是细胞抽提物和上清液同时上样检测。怕用细胞抽提物来做与实际表达量的相关性不好,你有没有见过类似的文献或者操作protocol的啊?
再答: 我做过类似的实验。浓缩的时候用的透析袋,但这种做法误差大。蛋白是降解,但能检测出来。直接点上清液是没用的,很难检测到上清中细胞分泌的蛋白。因为浓度太小。细胞抽提物可以。不能说没有相关性,因为就算是分泌蛋白细胞里边还会有的。
再问: 觉得你说的最靠谱,你说浓缩上清至原体积的1/30-1/10,是浓缩离心还是氮吹?这个时间应该有点长,总觉得怕蛋白降解或者不稳定啊。 我看的文献都是取上清做的,但是没有说具体操作。 老师的建议是细胞抽提物和上清液同时上样检测。怕用细胞抽提物来做与实际表达量的相关性不好,你有没有见过类似的文献或者操作protocol的啊?
再答: 我做过类似的实验。浓缩的时候用的透析袋,但这种做法误差大。蛋白是降解,但能检测出来。直接点上清液是没用的,很难检测到上清中细胞分泌的蛋白。因为浓度太小。细胞抽提物可以。不能说没有相关性,因为就算是分泌蛋白细胞里边还会有的。
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