设计茎环引物 扩增 测序
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/07/09 22:44:13
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直接发送给我,我帮你设计.
合成的单链在实验时又一个和模板结合的退火过程,在这个过程中会自动形成茎环结构,如果你的茎环结构设计合理的话.我也在类似文献上看到过上游引物含有额外的碱基,上面有说明的,是为了调整Tm值.上游引物不能全
microRNA的茎环引物可以自己设计.据说有公司也可以帮忙合成,不过还是自己设计好了发过去比较省钱吧.内参一般是U6,因为它长度和microRNA一样比较短.我做的反转录内参是跟microRNA分开
当然可以咯,不过我没明白为什么上游引物GCrich跟分两段扩增有什么关系,1.2K一次扩增是完全没有问题的,如果上游引物出现GCrich的情况,那么可以考虑在更加上游的地方设计引物啊,在这个基因外测的
全部打断,加接头,然后引物设计在接头上.
ATCG.原理就是体外环境模仿人体内环境,完成人体内的DNA复制,大概就这样.
试试吧.退火温度低一些50左右
把这段基因输入设计软件里,调节引物位置,使变性温度在94度,退火温度=Tm-(5到10度)延伸温度72度左右,满足这些条件基本就可以了,当然还要根据实际情况多次实验得到最佳引物.如果你要扩增整个的基因
若是根据已知序列扩增未知物种的相应序列,可以根据先根据已知序列进行Blast搜索,发现其他同源序列,保存后进行比对,找出其中较保守区域,并根据Primer或Oligo等软件对某条序列进行分析,搜索其中
cDNA再问:真核基因转染其他细胞时一般选择表达DNA还是mRNA?再答:转进去的是DNA。整合到受体基因,表达mRNA再问:那你研究某一基因时,若需克隆你是不是一般以DNA序列设计引物啊?若是以mR
cDNA和mRNA的序列是互补的,如果用两个引物,最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段.由于引物方向从5‘至3’,所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可.
首先请上NCBIBLAST搜索之(blastp).或许可以直接查到你研究物种的基因序列.即使没有,有近缘物种的基因序列也是个好的参考,通过比对,选择序列保守区设计引物.若搜索不到任何信息,就需要通过设
如果这两个引物特异性很好,扩出来的不是非特异性片段,那么大小应该是一样的,只不过若有等位基因存在的话,会出现个别碱基缺失,也就是会有几b的差异.
对于这种情况,如果你只是找不到扩增引物的序列,但是能找到后面所要扩增的序列的话,那么可能还是因为测序引物离你的扩增片断太近.如果不是这种情况,那么可能是你根本没有将扩增片断成功连入当然还有一种可能是公
引物长度和专一性常见的引物长度为18-30个碱基.短的引物(≤15碱基)能非常高效地结合,但是它们的专一性不够.较长的引物能提高专一性,然而退火效率低,从而导致PCR产量低下.同时应避免编码单一序列和
16个退火温度太低了吧18-20不错再问:我需要使退火温度低点。16个会导致非特异性扩增吗再答:会不会有非特异性扩增得去blast一下才知道不过肯定是越短概率越大就是
PCR产物测序的最大风险是有在凝胶上看起来的一个条带,实际上有多个分子.也就是说长度相似的分子有可能在电泳的时候只有一条带.如果只是进行PCR产物回收,没有进行凝胶分离的过程的话,东西可能更多了.问题
这个问题很简单,扩增序列应该称为目的基因,目的基因一般都上万bp,从两头开始当然不合适.PCR扩增只能扩增出上下游引物之间的序列,因为只有引物之间的DNA双链是解链状态的.你的问题说明你对基础知识掌握
2758长的片段对引物没有啥特别的要求,25个bp以上的就行.关键是聚合酶的选择,要选保真性好的能过扩增长片段的酶.